巨大コンピュータ・システム「ヤオビクニ(八百比丘尼)」に統合管理された地下都市。人々がJunk Metal Cityと揶揄するこの遠隔都市では、混乱こそが日常だ。反電子頭脳を標榜するテロリスト集団「クマサンチーム」の暗躍。Cityの中央病院で起こった「奇妙な投薬ミス」の謎を追う都市管理会議のちょい渋めの捜査官達。Junk Metal Cityの東のはずれ、「Under」と呼ばれるスラム街に店を構えるうらぶれたジャンク屋「ゼンジイ商会」。そこに棲むモレキュラー・エレクトロニック・デバイス(生体電子機器)にやたら造詣の深い謎の技術屋「信」、そして彼が創ったヤオビクニに直結した分子電子自動人形… そんな爆裂野郎どもを巻き込んで、運命と呼ぶにはあまりにも過酷なプログラム「プログラムHOPE」が巨大電子頭脳ヤオビクニの中で人知れず起動した…